La iglesia se anexa al convento vecino, construido en 1507 bajo el título de San Maria del Popolo por la Hermana Lucrezia Di Leo de la orden de los Clarisse, en el lugar que había sido hasta 1492 el gueto judío de la ciudad y donde había una sinagoga, llamada popularmente "moschita".
Después de la supresión del monasterio, en 1579, la iglesia fue ocupada por el Colegio de Notarios. En 1596, la iglesia y el convento fueron cedidos a los padres agustinos, quienes en 1609 construyeron una iglesia nueva y majestuosa. La fachada es simple, pero vigorosa, en dos órdenes, enmarcada por robustas pilastras; completado en la segunda mitad del siglo XVII, fue retocado alrededor de 1922.
En el portal principal se encuentra la estatua del nicho de San Nicolás, colocada en 1687. El plan basilical tiene tres naves, divididas por poderosas columnas, con un gran crucero, una gran capilla. Capillas laterales rectangulares y profundas. La iglesia ha sufrido muchos daños a lo largo de los siglos; hoy aparece desnudo y, en la envoltura del edificio desnudo, se ve mejor la inmensidad de los espacios.
De particular interés son las dos pinturas de Pietro Novelli, visibles en las capillas del crucero: "La Virgen y San Agustín" y "San Nicolás de Tolentino"; La pila bautismal del siglo XV sobre un pedestal del siglo XVII y el altar mayor en mármol mixto del siglo XVIII.